Burada UNIX sistemi üzerinde MySQL'in kurulup yönetilmesi üzerinde durulacaktır. MySQL derlendikten sonra ilk yapılması gereken 'mysql' adlı veri tabanının server üzerine kurmaktır. Bu veri tabanı, server üzerindeki diğer veri tabanlarına erişim haklarını oldukça ayrıntılı bir şekilde tablolarında tutmaktadır.

Bu veri tabanının yaratılması için öncelikle root olarak login olunur ve aşağıdaki komutlar işletilir:

>cd <MySQL directory>/bin
>./mysql_install_db 

Böylece tüm verılerın tutulacagı '<MySQL directory>/var' dızını de yaratılmış olur.

Artık veri tabanı sunucusu arka planda çalıştırılabilir:

>./safe_mysqld & 

MySQL standart olarak 3306 numaralı portta çalışmaktadır.

Veri tabanı üzerinde her hakka sahip kullanıcı, aynı zamanda sistemin 'root'udur. şu anda root, MySQL sunucusuna şifresiz bağlanabilir. Güvenlik için bu süper kullanıcıya veri tabanına erişim şifresi verilmesi gerekir:

>./mysqladmin -u root -password '<şifre>'

Daha sonra bu şifre kullanılarak sunucuya bağlanılabilir:

>./mysql -u root -p
>Enter passwd: <şifre> 

Böylece istemci programımız sunucuya bir oturum başlatmış olur. Artık karşımıza çıkan komut satırından SQL komutlarını uygulayabiliriz:

Burada SQL standardına uyan data definition (create table ..., alter table ..., drop table ..., vs...) ve data manipulation (select ..., insert ..., update ..., vs...) komutları kullanılabilir.

MySQL'e özgü birtakım komutlar da vardır:

'mysql' veritabanına bağlanılarak erişim haklarına ilişkin tabloların yapısı görülebilir: